同一个分群,为什么有两个百分比
假设总事件数为 100,000,母群有 35,000 个事件,子群有 21,000 个事件。那么子群占母群的 60%,占总事件的 21%。两者都对,只是回答的问题不同。
占母群比例(%Parent)= 子群事件数 / 直接母群事件数 × 100
占总事件比例(%Total)= 子群事件数 / 总事件数 × 100
这里的总事件指样本根节点“所有事件”。比较导出的百分比之前,仍须确认实际参照群体。
调整事件数,看看比例怎样变化
- 占母群比例(%Parent)
- 60%
- 占总事件比例(%Total)
- 21%
子群事件数为零、分母大于零时,比例为 0%;分母为零时则无法计算,不能记为 0%。本演示只说明计数比例,不验证门控,也不估计统计不确定性。
为什么两个同名门也不一定能直接比较
门的名称相同,母群却可能不同。“CD4+ 占 T 细胞比例”和“CD4+ 占全部活细胞比例”不是同一指标。统计时保留分群路径,跨样本比较时核对定义是否一致。
可继续查看母群、子群与布尔门。
平均荧光强度与荧光强度中位数
FlowApp 中的 MFI 指所选通道、所选分群内事件值的算术平均数;荧光强度中位数是这些值排序后的中间值。它们不是百分比,也不自动代表绝对浓度。
不同资料或软件对 MFI 缩写的使用并不完全一致。报告中应写清统计名称和通道,不能默认所有名为“MFI”的列含义相同。
- 比较相同通道、相同分群定义和相同数据处理状态。
- 散点图的显示变换,不等于测量值已经换算为校准单位。
- 分布偏斜或有极端事件时,均值和中位数可能明显不同,须结合分布查看。
事件统计不等于分组的重复数
单个样本的荧光中位数来自该样本内的事件;报告中的组均值汇总的是样本级测量。采集到数万个事件,不等于有数万个独立供者或实验单位。
尽量在组汇总旁保留各样本结果;做推断统计前,明确生物学重复、技术重复和配对关系。缺失值仍是缺失值,不能填成零。
参考资料与后续操作
FlowJo 表格统计说明列出了母群比例、总事件比例及常见汇总定义。本页计算器及 FlowApp 特定行为说明依据当前软件实现。